口腔治疗师证书的颁发主要由卫生健康行政部门负责，具体来说，它是由国家卫生健康委员会或其授权的认证机构发放，这些机构会依据一定的标准和程序对口腔治疗师进行评估，确认他们的专业技能和知识，并给予相应的资格证书。

目前，我国大部分省份都设立了卫生健康行政部门，专门负责颁发口腔治疗师证书，在选择医疗机构或者学习口腔专业知识时，一定要看清楚证书是由哪个部门颁发的，才能确保自己的权益得到保障，也要注意证书的有效期，过期后可能无法再使用。