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「转」从2019-CoV肺炎更名为COVID-19,我们今天来聊一聊

从2019-CoV肺炎更名为COVID-19,我们今天来聊一聊
转自公众号:复旦儿科感染
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2019-CoV,改名了。很多人有些烧脑。
2020.2.11,世卫组织(WHO)总干事谭赛德先生宣布,经WHO和世界动物卫生组织(OIE)、联合国粮食及农业组织(FAO)协商,将2019-CoV病更名为COVID-19;“CO”代表Corona(冠状),“VI”代表Virus(病毒),“D”代表Disease(疾病),“19”代表疾病发现的年份2019年;谭赛德先生并说明,这种新病毒的命名不应影射任何地理位置、一种动物、一个个体或一个群体[1]。
与此同时,国际病毒分类委员会(InternationalCommittee on Taxonomy of Viruses,ICTV)的冠状病毒研究组根据2019-CoV与引发SARS的冠状病毒具有高度亲缘性,该新冠病毒正式命名为SARS-CoV-2,而由SARS-CoV-2引发的疾病就是COVID-19[2]。
2020.2.12,全球共享所有流感数据倡议(Global Initiative of Sharing AllInfluenza Data,GISAID)以COVID-19更新每日全球信息[3]。

GISAID全球COVID-19病例

回想2012年9月25日,WHO宣布从1例在英国发现的致命性冠状病毒感染与3天前在沙特阿拉伯的1例致命性冠状病毒感染相关,并暂时将这种新病毒命名为HCoV EMC/2012,随着对新病毒及相关疾病的不断认识,2013年5月23日,即大半年后,WHO宣布将新病毒更名为MERS-CoV。
到底病毒命名是怎么回事?我们在这里对动物病毒的命名做简单介绍,雅俗共赏。

一、经典系统
1962年Lwoff等病毒学家根据经典Linnaean等级系统,包括门、纲、目、科、属、种分类方法,建立了一种将所有已知病毒全面分类(细菌病毒、植物病毒、动物病毒)的系统方法。但后来成立的ICTV没有完全采纳这个系统,科、属、种的分类还是被用来分类动物病毒。如麻疹病毒,分类归为副粘病毒科、麻疹病毒属、麻疹病毒种。

这套系统蕴含两个最重要原则:病毒应当按照它们本身的共性分群,而不是根据它们所感染的细胞或机体性质分群;以核酸基因组作为分类的主要标准。

通过核酸和蛋白质序列相似性阐明进化关系的基因组学用于划分病毒科,将病毒科内成员排序,如亚科,如HSV1和HSV2等。

二、根据基因组类型分类

由于病毒基因组携带了病毒繁殖的完整蓝图,根据经典系统中已知的不同科的病毒,动物病毒以七种基因组类型(都感染脊椎动物)进行分类。

感染脊椎动物的病毒科 三、Baltimore分类系统
David Baltimore建立的新系统强调了病毒基因组和mRNA之间的密切关系。所有病毒必须产生能被细胞核糖体翻译的mRNA。在这系统中,不同病毒基因组产生mRNA的独特方式用于定义特异性病毒类别,其基础是病毒基因组的性质和极性。 Baltimore分类系统
四、病毒命名的复杂性
病毒发现者们到现在没有建立统一的命名系统。如在脊椎动物病毒中,有用相关疾病命名(如脊髓灰质炎病毒、狂犬病毒);有的用病毒引起的特异性疾病命名(如鼠白血病病毒);用感染部位或者初次分离部位命名(如鼻病毒、腺病毒);有用初次分离的地区命名(如在日本仙台发现的仙台病毒、在纽约柯莎奇发现的柯莎奇病毒);有用初次发现病毒的科学家命名(如Epstein-Barr病毒,病毒名称大写为EBV);有用人们以为的病毒感染方式命名(如登革病毒,“恶灵”的意思;流感病毒,污浊空气“影响”的意思);有基于病毒刚被感知的(如巨大的米米病毒);甚至有基于奇思妙想命名(如潘多拉病毒),还有上诉方式综合命名(如Rous肉瘤病毒)。其他的动物病毒,如流感病毒命名[如A/Chicken/Hongkong/202/97(H1N1),依次以抗原型别、宿主、发现地、毒株编号、分类年份、血凝素亚型、神经氨酸酶亚型]。细菌病毒、植物病毒命名也另有不同。
巨大的米米病毒 冠状病毒
五、Luria的信条
半个多世纪前,Salvador Luria在经典科教书《普通病毒学》引言中写道:“自然界事物都具有简单性的一面,科学研究的最终贡献是发现统一且简化的概括性规律,而不仅仅是描述相对孤立的情形—即提炼出简单的总体性特征,并不局限于对种种个案的追求。”
2019-CoV在生物学上的表现,确实与2002年的SARS-CoV(现在也可改为SARS-CoV-1了)非常相似,称为SARS-CoV-2比较简单些。
Salvador Luria
虽然现在我们发现越来越多经典原理无法解释、令人迷惑的现象。但基本原理仍存在:所有病毒遵循简单的策略确保其生存。人冠状病毒和蝙蝠冠状病毒,在许多病毒学原理上,非常接近。 ★ 一句话:目前病毒命名不统一、人类对病毒认识局限,2019-CoV肺炎更名为COVID-19,2019-CoV病毒更名为SARS-CoV-2,很正常。

参考文献

1.World Health Organization. WHO Director-General'sremarks at the media briefing on 2019-nCoV on 11 February 2020[EB/OL]. (2020-02-11)[2020-02-12].https://www.who.int/dg/speeches/detail/who-director-general-s-remarks-at-the-media-briefing-on-2019-ncov-on-11-february-2020.
2.International Committee on Taxonomy of Viruses. Namingthe 2019 Coronavirus. [EB/OL]. (2020-02-11) [2020-02-12]. https:// talk. ictvonline. org.
3. Global Initiative of Sharing All Influenza Data.Global cases ofBetaCoV. [EB/OL].(2020-02-12)[2020-02-12].https://www.gisaid.org/epiflu-applications/global-cases-betacov/.
撰文:沈 军;校稿:王建设

本期编辑:常春藤
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